Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms