Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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