Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Subh2bvQ9D9Z7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Subh2bvQ9D9Z7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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