Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp4bQ9D8B3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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