Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D2Q3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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