Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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