Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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