Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms