Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrtQ99MR6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms