Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtprtQ99M80 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtprtQ99M80 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtprtQ99M80 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PtprtQ99M80 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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