Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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