Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp16Q99LG0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp16Q99LG0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp16Q99LG0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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