Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms