Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab28Q99KL7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab28Q99KL7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab28Q99KL7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rab28Q99KL7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab28Q99KL7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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