Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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