Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TrabdQ99JY4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms