Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms