Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Smim11aQ99J19 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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