Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ncapd2Q8K2Z4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ncapd2Q8K2Z4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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