Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem17Q8K0U3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem17Q8K0U3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms