Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Card11Q8CIS0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms