Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Brf1Q8CFK2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Brf1Q8CFK2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Brf1Q8CFK2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Brf1Q8CFK2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Brf1Q8CFK2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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