Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms