Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms