Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms