Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo38Q8BMI0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms