Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms