Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cyp4f39Q8BGU0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cyp4f39Q8BGU0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms