Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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ChfrQ810L3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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ChfrQ810L3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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ChfrQ810L3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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