Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrfn4Q80XU8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrfn4Q80XU8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrfn4Q80XU8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrfn4Q80XU8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrfn4Q80XU8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrfn4Q80XU8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Lrfn4Q80XU8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms