Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pnma8aQ80VM8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms