Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NischQ80TM9 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms