Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms