Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Dsg1bQ7TSF1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Dsg1bQ7TSF1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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