Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms