Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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