Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RgmaQ6PCX7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms