Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttbk1Q6PCN3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttbk1Q6PCN3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms