Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt40Q6IFX3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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