Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms