Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VcanQ62059 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms