Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms