Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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