Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms