Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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