Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnpc3Q3UZ01 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms