Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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