Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms