Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5460Q3UQ97 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5460Q3UQ97 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms