Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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